جلد 42، شماره 3 - ( 7-1397 )
جلد 42 شماره 3 صفحات 188-182 |
برگشت به فهرست نسخه ها
Download citation:
BibTeX | RIS | EndNote | Medlars | ProCite | Reference Manager | RefWorks
Send citation to:
BibTeX | RIS | EndNote | Medlars | ProCite | Reference Manager | RefWorks
Send citation to:
Nourbazargan H, Nadji A, Mirab Samiee S, Paryan M, Mohammadi-Yeganeh S. Design and development of TaqMan Real-time PCR assay for detection and viral load determination of HIV-1. Research in Medicine 2018; 42 (3) :182-188
URL: http://pejouhesh.sbmu.ac.ir/article-1-1855-fa.html
URL: http://pejouhesh.sbmu.ac.ir/article-1-1855-fa.html
نوربازرگان حسن، ناجی علیرضا، میراب سمیعی سیامک، پریان مهدی، محمدی یگانه سمیرا. طراحی و راه اندازی روش TaqMan Real-time PCR جهت تشخیص و تعیین کمی ویروس نقص ایمنی اکتسابی نوع1 (HIV-1). پژوهش در پزشکی. 1397; 42 (3) :182-188
، smyeganeh@gmail.com
چکیده: (4221 مشاهده)
سابقه وهدف: ویروس نقص ایمنی انسانی نوع 1 ( HIV-1 ) یکی از مهمترین عوامل عفونی منتقل شده از طریق خون است که یک معضل جهانی محسوب
می شود، بنابراین تشخیص صحیح، دقیق و حساس این ویروس از اهمیت بسیاری برخوردار است. هدف از این مطالعه، طراحی یک روش حساس بر پایه
Real-time PCR TaqMan برای تشخیص HIV-1 می باشد.
مواد و رو شها: آغازگرها و پروب توسط نرم افزارهای بیوانفورماتیکی برای یک ناحیه 199 جفت بازی برای ژن INT HIV-1 طراحی شد. استانداردهای مورد
استفاده برای تعیین حساسیت آنالیتیکی با استفاده از RNA های حاصل از رونویسی در آزمایشگاه تهیه شد. همچنین برای بررسی اختصاصی آنالیتیکی از پایگاه Blast
و اختصاصیت کلینیکی با استفاده از پانل های ویروسی مختلف و نمونه ژنوم حاصل از افراد سالم استفاده شد.
یافته ها: این روش قادر به اندازه گیری حداقل 10 کپی از HIV-1 RNA در هر میلی لیتر است. علاوه بر این، آزمایش در محدوده 10 - 109 کپی در میلی لیتر خطی
است. با بررسی نمونه های منفی، ویژگی این روش 100 درصد می باشد. نتایج تکرارپذیری واکنش در سطح درون سنجی و بین سنجی بررسی شد برای این منظور
9 تکرار از هر غلظت از نمونه کنترل در هر واکنش کاری مورد بررسی قرار گرفت.
نتیج هگیری: با توجه به سطح حساسیت و ویژگی مناسب، آنالیز سریع، کاربرد آسان و هزینه نسبتاً کم در مقابل کیت های مشابه، این روش م یتواند برای
تشخیص موثر ویروس HIV-1 مناسب باشد. همچنین می توان آلودگی به ویروس را قبل از تغییرات سرمی و ظهور آنتی بادی ها در خون تشخیص داد و دوره پنجره
عفونت را کوتا هتر کرد.
می شود، بنابراین تشخیص صحیح، دقیق و حساس این ویروس از اهمیت بسیاری برخوردار است. هدف از این مطالعه، طراحی یک روش حساس بر پایه
Real-time PCR TaqMan برای تشخیص HIV-1 می باشد.
مواد و رو شها: آغازگرها و پروب توسط نرم افزارهای بیوانفورماتیکی برای یک ناحیه 199 جفت بازی برای ژن INT HIV-1 طراحی شد. استانداردهای مورد
استفاده برای تعیین حساسیت آنالیتیکی با استفاده از RNA های حاصل از رونویسی در آزمایشگاه تهیه شد. همچنین برای بررسی اختصاصی آنالیتیکی از پایگاه Blast
و اختصاصیت کلینیکی با استفاده از پانل های ویروسی مختلف و نمونه ژنوم حاصل از افراد سالم استفاده شد.
یافته ها: این روش قادر به اندازه گیری حداقل 10 کپی از HIV-1 RNA در هر میلی لیتر است. علاوه بر این، آزمایش در محدوده 10 - 109 کپی در میلی لیتر خطی
است. با بررسی نمونه های منفی، ویژگی این روش 100 درصد می باشد. نتایج تکرارپذیری واکنش در سطح درون سنجی و بین سنجی بررسی شد برای این منظور
9 تکرار از هر غلظت از نمونه کنترل در هر واکنش کاری مورد بررسی قرار گرفت.
نتیج هگیری: با توجه به سطح حساسیت و ویژگی مناسب، آنالیز سریع، کاربرد آسان و هزینه نسبتاً کم در مقابل کیت های مشابه، این روش م یتواند برای
تشخیص موثر ویروس HIV-1 مناسب باشد. همچنین می توان آلودگی به ویروس را قبل از تغییرات سرمی و ظهور آنتی بادی ها در خون تشخیص داد و دوره پنجره
عفونت را کوتا هتر کرد.
نوع مطالعه: پژوهشی |
دریافت: 1396/11/27 | پذیرش: 1397/4/31 | انتشار: 1397/7/9
دریافت: 1396/11/27 | پذیرش: 1397/4/31 | انتشار: 1397/7/9
ارسال پیام به نویسنده مسئول
| بازنشر اطلاعات | |
 |
این مقاله تحت شرایط Creative Commons Attribution-NonCommercial 4.0 International License قابل بازنشر است. |
This Journal is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 International License | Research in Medicine
Designed & Developed by : Yektaweb