با وجود پیشرفت­های قابل ملاحظه­ای که در آزمایشات بیوشیمی با تکنیک­های مدرن و دقیق امروزه بوجود آمده است در اشعه میکروبیولژی جهش چشمگیری از نظر سرعت و قاطعیت جواب­ها دیده می­شود.
در تعداد زیادی از آزمایش­های میکربی جواب­های گمراه کننده بدلایل زیر وجود دارند:
1- وجود مخلوط­های میکربی در مواد پاتولژیکی.
2- میکرب­هائی که در بعضی نقاط بدن جزء فلور طبیعی محسوب گردیده و در بسیاری نقاط دیگر ایجاد بیماری می­نمایند.
٣- بسیاری از میکرب­های غیر بیماری­زا با ازدیاد خود می­توانند ایجاد عفونت نمایند.
4- عده­ای از میکرب­های بیماری­زا با مقادیر کم ممکن است تولید عفونت نمایند.
5- ممکن است در محیط کشت چند میکرب بیماری­زا کشت شود ولی عامل اصلی تولید عفونت فقط یکی از آن میکرب­ها باشد.