جلد 45، شماره 2 - ( 4-1400 )
جلد 45 شماره 2 صفحات 91-82 |
برگشت به فهرست نسخه ها
Download citation:
BibTeX | RIS | EndNote | Medlars | ProCite | Reference Manager | RefWorks
Send citation to:
BibTeX | RIS | EndNote | Medlars | ProCite | Reference Manager | RefWorks
Send citation to:
Moazeny M, Hojati Z, Esmaeili F, Salari A. Candidate roles of two miR-383 and miR-380-3p in neural differentiationiation. Research in Medicine 2021; 45 (2) :82-91
URL: http://pejouhesh.sbmu.ac.ir/article-1-2885-fa.html
URL: http://pejouhesh.sbmu.ac.ir/article-1-2885-fa.html
موذنی مرضیه، حجتی زهره، اسماعیلی فریبا، سالاری علی. گزارش دو miRNA 383 و 380-3p به داشتن نقش در تمایز سلول های عصبی. پژوهش در پزشکی. 1400; 45 (2) :82-91
گروه زیست شناسی سلولی مولکولی و میکروبیولوژی دانشکده علوم و فناوری های زیستی، دانشگاه اصفهان. اصفهان. ایران ، z.hojati@sci.ui.ac.ir
چکیده: (2019 مشاهده)
سابقه و هدف: مکانیسم پیچیده تمایز سلول های عصبی همیشه یک چالش بزرگ جهت شناخت جامع همه miRNA های دارای نقش در تمایز سلول های عصبی بوده است. از همین رو miRNA های زیادی در تمایز عصب شناخته نشده اند. به همین جهت استفاده از داده های حجیم با کمک علوم کامپیوتر راه حل مناسبی جهت بررسی همه جانبه miRNA های احتمالی دارای نقش در مکانیسم تمایز سلولی می تواند باشد. مطالعه حاضر با هدف یافتن miRNA های کلیدی در مکانیسم تمایز سلول های عصبی جهت درمان آسیب های عصبی با استفاده از سلول درمانی صورت گرفته است.
مواد و روش ها: جهت متاآنالیز داده های ترانسکریپتوم، 5 دیتاست ماکرواری، مورد استفاده قرار گرفت. که 4 دیتاست مربوط به بررسی ژن های افتراقی و 1 دیتاست مربوط به miRNA های افتراقی بودند. نتایج بدست آمده ژن های افتراقی توسط دیتابیس های miRTarBase و TargetScan مورد بررسی قرار گرفت تا اینکه نتایجmiRNA های بدست آمده با نتایج آنالیز miRNA های افتراقی مقایسه شد و miRNA 4 دارای بیان افتراقی معنادار در مسیر عصبی بدست آمد. سپس توسط ابزارهای Cytoscape شبکه های پروتئینی و مسیرهای زیستی( Biological Process) ترسیم شد.
یافته ها: نتیجه متاآنالیز 4 دیتاست ژنی، 443 ژن و حاصل آنالیز دیتاست miRNA 148 ،miRNA ، با بیان افتراقی بود. سپس miRNA 800 دارای برهمکنش با 443ژن افتراقی از دیتابیس های miRNA بدست آمد که تنها miRNA 4 دارای اشتراک با miRNA 148 آنالیز شده، در تمایز سلول های عصبی گزارش شدند. که از این بین miRNA 2 در مطالعات گذشته دارای گزارش بوده و تنها دو 380-3p miRNA و 383 که در مطالعه حاضر که باقی مانده بودند گزارش شدند.
نتیجه گیری: به نظر می رسد که دو miRNA 380-3p و 383 در تمایز سلول های عصبی دارای اثر باشند، در نتیجه جهت سلول درمانی و بهینه سازی تمایز سلولهای عصبی در این مطالعه برای اولین بار کاندید می شوند.
مواد و روش ها: جهت متاآنالیز داده های ترانسکریپتوم، 5 دیتاست ماکرواری، مورد استفاده قرار گرفت. که 4 دیتاست مربوط به بررسی ژن های افتراقی و 1 دیتاست مربوط به miRNA های افتراقی بودند. نتایج بدست آمده ژن های افتراقی توسط دیتابیس های miRTarBase و TargetScan مورد بررسی قرار گرفت تا اینکه نتایجmiRNA های بدست آمده با نتایج آنالیز miRNA های افتراقی مقایسه شد و miRNA 4 دارای بیان افتراقی معنادار در مسیر عصبی بدست آمد. سپس توسط ابزارهای Cytoscape شبکه های پروتئینی و مسیرهای زیستی( Biological Process) ترسیم شد.
یافته ها: نتیجه متاآنالیز 4 دیتاست ژنی، 443 ژن و حاصل آنالیز دیتاست miRNA 148 ،miRNA ، با بیان افتراقی بود. سپس miRNA 800 دارای برهمکنش با 443ژن افتراقی از دیتابیس های miRNA بدست آمد که تنها miRNA 4 دارای اشتراک با miRNA 148 آنالیز شده، در تمایز سلول های عصبی گزارش شدند. که از این بین miRNA 2 در مطالعات گذشته دارای گزارش بوده و تنها دو 380-3p miRNA و 383 که در مطالعه حاضر که باقی مانده بودند گزارش شدند.
نتیجه گیری: به نظر می رسد که دو miRNA 380-3p و 383 در تمایز سلول های عصبی دارای اثر باشند، در نتیجه جهت سلول درمانی و بهینه سازی تمایز سلولهای عصبی در این مطالعه برای اولین بار کاندید می شوند.
واژه‌های کلیدی: تمایز سلول های عصبی، متاآنالیز داده های ماکرواری، بیوانفورماتیک، زیست شناسی سامانه ای. miRNA
نوع مطالعه: پژوهشی |
موضوع مقاله:
علوم سلولی( سلولی مولکولی، سلول های بنیادی)
دریافت: 1399/2/13 | پذیرش: 1399/6/15 | انتشار: 1400/9/8
دریافت: 1399/2/13 | پذیرش: 1399/6/15 | انتشار: 1400/9/8
ارسال پیام به نویسنده مسئول
| بازنشر اطلاعات | |
 |
این مقاله تحت شرایط Creative Commons Attribution-NonCommercial 4.0 International License قابل بازنشر است. |
This Journal is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 International License | Research in Medicine
Designed & Developed by : Yektaweb