جستجو در مقالات منتشر شده


۲ نتیجه برای بیوانفورماتیک
گزارش دو miRNA ۳۸۳ و ۳۸۰-۳p به داشتن نقش در تمایز سلول های عصبی
مرضیه موذنی، زهره حجتی، فریبا اسماعیلی، علی سالاری،
جلد ۴۵، شماره ۲ - ( ۴-۱۴۰۰ )
چکیده
سابقه و هدف: مکانیسم پیچیده تمایز سلول های عصبی همیشه یک چالش بزرگ جهت شناخت جامع همه miRNA های دارای نقش در تمایز سلول های عصبی بوده است. از همین رو miRNA های زیادی در تمایز عصب شناخته نشده اند. به همین جهت استفاده از داده های حجیم با کمک علوم کامپیوتر راه حل مناسبی جهت بررسی همه جانبه miRNA های احتمالی دارای نقش در مکانیسم تمایز سلولی می تواند باشد. مطالعه حاضر با هدف یافتن miRNA های کلیدی در مکانیسم تمایز سلول های عصبی جهت درمان آسیب های عصبی با استفاده از سلول درمانی صورت گرفته است.
مواد و روش ها: جهت متاآنالیز داده های ترانسکریپتوم، ۵ دیتاست ماکرواری، مورد استفاده قرار گرفت. که ۴ دیتاست مربوط به بررسی ژن های افتراقی و ۱ دیتاست مربوط به miRNA های افتراقی بودند. نتایج بدست آمده ژن های افتراقی توسط دیتابیس های miRTarBase و TargetScan مورد بررسی قرار گرفت تا اینکه نتایجmiRNA های بدست آمده با نتایج آنالیز miRNA های افتراقی مقایسه شد و miRNA ۴ دارای بیان افتراقی معنادار در مسیر عصبی بدست آمد. سپس توسط ابزارهای Cytoscape شبکه های پروتئینی و مسیرهای زیستی( Biological Process) ترسیم شد.
یافته ها: نتیجه متاآنالیز ۴ دیتاست ژنی، ۴۴۳ ژن و حاصل آنالیز دیتاست miRNA ۱۴۸ ،miRNA ، با بیان افتراقی بود. سپس miRNA ۸۰۰ دارای برهمکنش با ۴۴۳ژن افتراقی از دیتابیس های miRNA بدست آمد که تنها miRNA ۴ دارای اشتراک با miRNA ۱۴۸ آنالیز شده، در تمایز سلول های عصبی گزارش شدند. که از این بین miRNA ۲ در مطالعات گذشته دارای گزارش بوده و تنها دو ۳۸۰-۳p miRNA و ۳۸۳ که در مطالعه حاضر که باقی مانده بودند گزارش شدند.
نتیجه گیری: به نظر می رسد که دو miRNA ۳۸۰-۳p و ۳۸۳ در تمایز سلول های عصبی دارای اثر باشند، در نتیجه جهت سلول درمانی و بهینه سازی تمایز سلولهای عصبی در این مطالعه برای اولین بار کاندید می شوند.

بررسی فراوانی جهش ژن thyA و میزان مقاومت به داروی پارا- آمینوسالیسیلیک اسید در سویه‌های بالینی مایکوباکتریوم توبرکلوزیس مقاوم به دارو در شهر تهران در سال ۱۴۰۰-۱۳۹۷
خانم هانیه باقری فرد، دکتر میترا صالحی، دکتر مونا قاضی،
جلد ۴۷، شماره ۴ - ( ۱۲-۱۴۰۲ )
چکیده
سابقه و هدف: پیدایش مقاومت‌های دارویی و ظهور سویه‏های مایکوباکتریوم توبرکلوزیس مقاوم به درمان، کنترل این بیماری را با چالش مواجه ساخته است. بنا به آمار سازمان بهداشت جهانی (WHO)، سالانه در سراسر جهان حدود ۰۰۰,۵۰۰ مورد ابتلای جدید سل مقاوم به دارو گزارش می‏شود. با توجه به اینکه مکانیسم‏های مرتبط با بروز مقاومت‌های دارویی به درستی شناخته نشده است و تحقیق‌های مختلف نشان‏دهنده نتایج متفاوتی است، بر آن شدیم تا به بررسی جهش‏های ژن thyA در ارتباط با مقاومت به داروی پارا- آمینوسالیسیلیک اسید (PAS) بپردازیم.
روش کار: در این مطالعه توصیفی- مقطعی، در مدت سه سال تعداد ۲۵۵ نمونه‏ مثبت مایکوباکتریوم توبرکلوزیس با استفاده از روش استاندارد کشت و اسمیر جداسازی شد، سپس با انجام آزمون حساسیت‏سنجی دارویی ۶۸ نمونه سل مقاوم به دارو انتخاب شد. برای بررسی جهش‌های ژن‏ thyA، از روش PCR استاندارد استفاده شد و قطعه‌های حاصله توالی‏یابی شدند. جهش‏های منجر به تغییر کدون، با به کارگیری نرم‏افزارهای پیش‏بینی تغییرهای پروتئین آنالیز شدند. ارتباط جهش‏های یافت ‏شده با مقاومت به داروی PAS از لحاظ آماری توسط آزمون مربع کای مطالعه شد.
یافته‌ها: از ۲۵۵ نمونه مورد بررسی، ۶۸ سویه (۲۶/۷درصد، فاصله اطمینان ۲۱/۳درصد) مقاوم به دارو تعیین شد. مجموعاً ۱۳ نمونه (۱۹/۱درصد) سویه مقاوم به PAS یافت شد که ۵ سویه (۳۸/۴درصد) دارای جهش‌های نوکلئوتیدی مختلف در ژن thyA بودند. از لحاظ آماری ارتباط جهش‏های مذکور با مقاومت آنتی‏بیوتیکی معنادار بود. به علاوه، نتایج آنالیز بیوانفورماتیک نشان داد که جهش‏های یافت‏شده منجر به اختلال در عملکرد و ناپایداری در ساختار پروتئین حاصله می‏شوند.
نتیجه‌گیری: طبق نتایج به دست آمده به نظر می‏رسد که جهش‏ در ژن thyA با مقاومت به داروی PAS مرتبط است. همچنین یافته‏ها ارزش تشخیصی آنالیز قطعه‌های کوچک ژنومی و ابزارهای نوین بیوانفورماتیک را در شناسایی مکانیسم‏های مقاومت دارویی نشان می‏دهد.
صفحه ۱ از ۱     

Creative Commons License
This Journal is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 International License | Research in Medicine

Designed & Developed by : Yektaweb