fa تایپینگ مولکولی سویه‌های کلستریدیوم دیفیسیل جدا شده از بیماران بستری به روش PCR-Ribotyping میکروب‌شناسی Microbiology پژوهشی Original <p>چکیده سابقه و هدف: عفونت ناشی از کلستریدیوم دیفیسیل معضل در حال گسترشی در بیمارستان است که شیوع بالایی از آن در سال-های اخیر گزارش شده است. شناسایی منبع عفونت کلستریدیوم دیفیسیل در کنترل و جلوگیری از گسترش عفونت بیمارستانی ناشی از آن از اهمیت به سزایی برخوردار است. با توجه به اینکه روش PCR ribotyping اخیرا به عنوان روشی موثر در مطالعه اپیدمیولوژیکی سویه‌های کلستریدیوم دیفیسیل پیشنهاد شده است، این تحقیق انجام گرفت. روش بررسی: مطالعه در طی یک دوره 12 ماهه به صورت توصیفی صورت پذیرفت. 17 نمونه کلستریدیوم دیفیسیل از بیماران مشکوک به عفونت با کلستریدیوم دیفیسیل جداسازی گردید. تمامی نمونه‌های مدفوع با شوک الکل و محیط عصاره مخمر تیمار شدند. سپس از سوسپانسیون تیمار شده روی محیط اختصاصی سیکلوسرین سفوکسیتین فروکتوز آگار(CCFA) غنی شده با 5 درصد خون گوسفند به روش خطی کشت و در شرایط بیهوازی تا 5 روز انکوبه شدند. شیوع ایزوله‌ها تعیین و میزان واقعی آن (Confidence Interval) در جامعه برآورد گردید. برای تعیین هویت قطعی، ژن cdd-3و همچنین تعیین پروفایل توکسینی، ژن‌های tcdA،tcdB با استفاده از روش PCR شناسایی شدند. جهت شناسایی ریبوتایپ بر روی نمونه‌های کلستریدیوم دیفیسیل بدست آمده از بیماران بستری در بیمارستان با استفاده از پرایمرهای اختصاصی ژن‌های ریبوزومی PCR گذاشته شد. یافته‌ها: از 108 نمونه ارسالی، 17(7/15%) نمونه مثبت بود. فراوانی ایزوله‌های با پروفایل توکسینی A+B+ 12 (59/70%)، A+B- 1(9/5%) و A-B+ 4 (9/23%) گزارش شد. آنالیز ریبوتایپینگ ایزوله‌ها نشان داد که تمامی آنها دارای الگوی باندی متفاوت هستند. نتیجه‌گیری: به نظر می‌رسد که ریبوتایپ‌های در حال گردش در بخش‌های مختلف بیمارستان متفاوت بوده و عفونت ممکن است به دلیل سویه‌های اندوژن یا کسب سویه‌های بیماری‌زا از محیط باشد. واژگان کلیدی: کلستریدیوم دیفیسیل، توکسین، ریبوتایپینگ.</p> <p>Abstract Background: Clostridium difficile infection (CDI) has been a major growing problem in hospitals in recent years. Detection of the source of Clostridium difficile strains is of importance for the control of the nosocomial spread of this microorganism. This study was done to identify C.difficile isolates by polymerase chain reaction, (PCR), ribotyping. Materials and methods: The descriptive study was done during a period of 12 month. Seventeen C.difficile isolates were collected from patients hospitalized with suspected CDI in different wards of a general hospital. All samples were treated with alcohol and yeast extract broth. The treated samples were cultured on a selective cycloserine cefoxitin fructose agar (CCFA) supplemented with 5% sheep blood and incubated in anaerobic conditions, at 37 °C for 5 days. Prevalence and confidence intervals were calculated. Cdd-3, tcdA and tcdB genes were identified using PCR assay. PCR ribotyping was performed on C.difficile isolates. Results: Out of 108 isolates 17(15.7%) were C.difficile. The prevalence of A+B+ , A+ B- and A- B+ strains were 12(70.59%), 1(5.9%) and 4(23.9%) respectively. PCR ribotyping of 17 isolates showed different ribotype patterns. Conclusion: The pattern of PCR ribotypes of isolates showed that the strains circulating in different wards of the hospital were different and may have been be endogenous or community acquired. Keywords: Clostridium difficile, Toxin, ribotype, Clostridium difficile infection (CDI).</p> واژگان کلیدی: کلستریدیوم دیفیسیل, توکسین, ریبوتایپینگ. Keywords: Clostridium difficile, Toxin, ribotype, Clostridium difficile infection (CDI). 68 75 http://pejouhesh.sbmu.ac.ir/browse.php?a_code=A-10-1-599&slc_lang=fa&sid=1 Mehdi Goudarzi مهدی گودرزی 10031947532846008764 10031947532846008764 No Tehran, Iran -Gastroenterology and Liver Diseases Research Center, Shahid Beheshti University of Medical Sciences, Tehran, Iran مرکز تحقیقات گوارش و کبد ، دانشگاه علوم پزشکی شهید بهشتی Hossein Goudarzi حسین گودرزی 10031947532846008765 10031947532846008765 No Tehran, Iran -Gastroenterology and Liver Diseases Research Center, Shahid Beheshti University of Medical Sciences, Tehran, Iran گروه میکروب شناسی، دانشکده پزشکی، دانشگاه علوم پزشکی شهید بهشتی Masood Albouyeh مسعود آل بویه 10031947532846008766 10031947532846008766 No Tehran, Iran -Gastroenterology and Liver Diseases Research Center, Shahid Beheshti University of Medical Sciences, Tehran, Iran مرکز تحقیقات گوارش و کبد ، دانشگاه علوم پزشکی شهید بهشتی Masoomeh Azimi Rad معصومه عظیمی‌راد 10031947532846008767 10031947532846008767 No Tehran, Iran -Gastroenterology and Liver Diseases Research Center, Shahid Beheshti University of Medical Sciences, Tehran, Iran مرکز تحقیقات گوارش و کبد ، دانشگاه علوم پزشکی شهید بهشتی Mohammad Reza Zali محمدرضا زالی 10031947532846008768 10031947532846008768 No Tehran, Iran -Gastroenterology and Liver Diseases Research Center, Shahid Beheshti University of Medical Sciences, Tehran, Iran مرکز تحقیقات گوارش و کبد ، دانشگاه علوم پزشکی شهید بهشتی Mohammad Mahdi Aslan محمدمهدی اصلانی mmaslani@yahoo.com 10031947532846008769 10031947532846008769 Yes Department of Microbiology, Pasteur Institute of Tehran, Tehran, Iran -Gastroenterology and Liver Diseases Research Center, Shahid Beheshti University of Medical Sciences, Tehran, Iran مرکز تحقیقات گوارش و کبد ، دانشگاه علوم پزشکی شهید بهشتی گروه میکروب شناسی،- انستیتو پاستور تهران