fa بررسی اپی توپ های خطی ایمونوژن ایمونوگلوبولین G انسان به روش ایمونوانفورماتیک ایمنی‌شناسی Immunology پژوهشی Original <p><strong>سابقه و هدف:</strong> ایمونوگلوبولین G (IgG) فراوانترین آنتی بادی سرم و مایعات خارج سلولی بوده و سطح IgG سرم با شدت بیماریهایی مثل نقائص ایمنی، عفونتها و بیماریهای خود ایمنی ارتباط دارد. لذا IgG ارزش تشخیصی بالایی دارد. ایمونوانفورماتیک، شاخه ای از علم ایمونولوژی است که با استفاده از اطلاعات زیستی در کامپیوتر به حل مسائل ایمونولوژیک، فهم بهتر پاسخهای ایمنی وتشخیص دقیق تر بیماریها کمک می کند. این پژوهش با هدف تعیین اپی توپهای ایمونوژن خطی IgG انسان با استفاده از ایمونوانفورماتیک انجام شد.</p> <p><strong>روش بررسی</strong>: توالی و ساختار سوم IgG مرجع انسان در پایگاه داده PDB، ساختار دوم آن توسط نرم افزار Phyre2 و اپی توپهای خطی آن توسط نرم افزارهای Ellipro و IEDB تعیین شدند.</p> <p><strong>یافته ها:</strong> مهمترین اپی توپهای خطی IgG انسان توسط نرم افزار IEDB در ناحیه بین اسید آمینه های 160 تا 175 در زنجیره سبک و 350 تا 360 در زنجیره سنگین معرفی شدند. ۱۱ اپی توپ خطی توسط نرم افزار Ellipro در دومینهای ثابت IgG انسان ( یکی در ناحیه اتصالی به آنتی ژن (Fab) و ۱۰ اپی توپ دیگر در ناحیه ثابت (Fc) در دومینهای ثابت 2 و 3 زنجیره سنگین (CH2 و (CH3 با توزیع مساوی( معرفی شد. شاخص ترین اپی توپها (۵ عدد) در دومین CH3 واقع شده ند.</p> <p><strong>&nbsp;نتیجه گیری:</strong> در این مطالعه تعداد قابل توجهی از اپی توپهای خطی IgG انسان شناسایی شدند. مطالعات آزمایشگاهی قبلی در این زمینه، تایید کننده این نتایج هستند. اپی توپهای تعیین شده ابزار مناسبی جهت تولید آنتی بادیهای مونوکلونال اختصاصی IgG، تعیین نقشه اپی توپهای IgG و مطالعات فیلوژنیک می باشند.</p> <p align="left">&nbsp;<strong> Background and objective </strong>: Immunoglobulin G (IgG) is the most abundant antibody in serum and extracellular fluids. The amount of serum IgG is associated to severity of some diseases like immunodeficiency, infections and autoimmunity. Therefore IgG has a high diagnostic value. Immunoinformatic is a branch of immunology which helps in solving of immunologic problems, well understanding of immune responses and precise diagnosis of diseases using the computational biology. The aim of this study is epitope mapping of human IgG by immunoinformatic approaches.</p> <p align="left">&nbsp;<strong> Methods of study </strong>: The amino acid sequence and third structure of reference human IgG was found in PDB database. The second IgG structure was determined by Phyre 2 software.&nbsp;IgG linear epitopes were determined by Ellipro and IEDB softwares.</p> <p align="left">&nbsp;<strong> Results: </strong>Linear epitopes are located in 160 - 175 and in 350 &ndash; 360 amino acid sequence of light and heavy chains respectively as was determined by IEDB software. 11 linear epitopes in constant domains of human IgG, one in fragment of antigen binding (Fab) and others in fragment of crystalizable (Fc) region (equally distributed in the second and third domains of IgG heavy chain constant region (CH2 and CH3) were determined by Ellipro. 5 main epitope are located in CH3 domain.</p> <p align="left">&nbsp;<strong> Conclusion: </strong>In this study a lot of linear epitopes located on human IgG were determined by two softwares and the results of previous experimental studies confirm our results. These epitopes are useful tools for producing specific monoclonal anti IgG antibodies, epitope mapping of human IgG and phylogenic studies.</p> <p></p> IgG انسان, ایمونوانفورماتیک, اپی توپ خطی Human IgG, Immunoinformatic, Linear epitope 30 35 http://pejouhesh.sbmu.ac.ir/browse.php?a_code=A-10-854-1&slc_lang=fa&sid=1 Fatemeh Hajighasemi فاطمه حاجی قاسمی resoome@yahoo.com 100319475328460029373 100319475328460029373 Yes Shahed University دانشگاه شاهد Soheila Rohani سهیلا روحانی 100319475328460029374 100319475328460029374 No Shahed University دانشگاه شاهد Fatemeh Sefid فاطمه سفید 100319475328460029375 100319475328460029375 No Shahed University دانشگاه شاهد