fa بررسی حضور ژن‌های فیمبریل pap، sfa و fimH درجدایه‌های اشریشیاکلی مقاوم به ایمی پنم به دست آمده از بیماران مبتلا به عفونت دستگاه ادراری در آزمایشگاه‌های شهر آمل در سال 1398-1397 میکروب‌شناسی Microbiology پژوهشی Original <div style="text-align: justify;"><strong><span style="font-family:B Mitra;"><span style="font-size:18.0pt;">سابقه و هدف:</span></span></strong><span style="font-family:B Mitra;"><span style="font-size:18.0pt;"> عفونت‌ادراری، یکی ‌‌از‌‌ شایع‌ترین عفونت‌های باکتریایی ‌در‌ جهان‌ است. <em>اشریشیاکلی</em> یوروپاتوژنیک یکی از عوامل اصلی ایجاد این عفونت است. حضور ژن‌های فیمبریه، سبب چسبندگی باکتری به سلول‌های مجاری ادراری می‌شوند. هدف از این مطالعه، بررسی حضور 3 ژن فیمبریال </span></span><em><span dir="LTR"><span style="font-family:Tahoma,sans-serif;"><span style="font-size:18.0pt;">papEF</span></span></span></em><span style="font-family:B Mitra;"><span style="font-size:18.0pt;">، </span></span><em><span dir="LTR"><span style="font-family:Tahoma,sans-serif;"><span style="font-size:18.0pt;">sfaD</span></span></span></em><span style="font-family:B Mitra;"><span style="font-size:18.0pt;"> و</span></span><em><span dir="LTR"><span style="font-family:Tahoma,sans-serif;"><span style="font-size:18.0pt;">fimH</span></span></span></em> <span style="font-family:B Mitra;"><span style="font-size:18.0pt;">&nbsp;در <em>اشریشیاکلی</em> جدا شده از بیماران مبتلا به عفونت دستگاه ادراری است. <span style="color:red;"></span></span></span><br> <strong><span style="color:black;"><span style="font-family:B Mitra;"><span style="font-size:18.0pt;">مواد و روش‌ها:</span></span></span></strong><span style="color:black;"><span style="font-family:B Mitra;"><span style="font-size:18.0pt;"> در این مطالعه، توصیفی-مقطعی، 235 نمونه ادراری به صورت تصادفی از افراد مبتلا به عفونت دستگاه ادراری در سال 1397 تا 1398 از آزمایشگاه‌های شهر آمل جمع‌آوری شد. ابتدا هرکدام از نمونه‌ها به طور جداگانه روی محیط کشت ائوزین متیلن بلو (</span></span></span><span dir="LTR"><span style="color:black;"><span style="font-family:Tahoma,sans-serif;"><span style="font-size:18.0pt;">EMB</span></span></span></span><span style="color:black;"><span style="font-family:B Mitra;"><span style="font-size:18.0pt;">)کشت داده شدند و سپس توسط تست‌های بیوشیمیایی نظیر ، </span></span></span><span dir="LTR"><span style="color:black;"><span style="font-family:Tahoma,sans-serif;"><span style="font-size:18.0pt;">&nbsp;IMViC</span></span></span></span><span style="color:black;"><span style="font-family:B Mitra;"><span style="font-size:18.0pt;">، </span></span></span><span dir="LTR"><span style="color:black;"><span style="font-family:Tahoma,sans-serif;"><span style="font-size:18.0pt;">TSI</span></span></span></span><span style="color:black;"><span style="font-family:B Mitra;"><span style="font-size:18.0pt;"> و اوره‌آز بررسی &nbsp;شدند. در نمونه‌های مثبت از نظر حضور <em>اشریشیاکلی</em> تست آنتی بیوگرام برای ارزیابی حساسیت به آنتی‌بیوتیک ایمی‌پنم انجام شد. پس از استخراج </span></span></span><span dir="LTR"><span style="color:black;"><span style="font-family:Tahoma,sans-serif;"><span style="font-size:18.0pt;">DNA</span></span></span></span><span style="color:black;"><span style="font-family:B Mitra;"><span style="font-size:18.0pt;"> از نمونه‌های مقاوم به ایمی‌پنم با روش جوشاندن، حضور ژن‌های فیمبریه </span></span></span><em><span dir="LTR"><span style="color:black;"><span style="font-family:Tahoma,sans-serif;"><span style="font-size:18.0pt;">papEF</span></span></span></span></em><span style="color:black;"><span style="font-family:B Mitra;"><span style="font-size:18.0pt;">، </span></span></span><em><span dir="LTR"><span style="color:black;"><span style="font-family:Tahoma,sans-serif;"><span style="font-size:18.0pt;">sfaD</span></span></span></span></em><span style="color:black;"><span style="font-family:B Mitra;"><span style="font-size:18.0pt;"> و</span></span></span><em><span dir="LTR"><span style="color:black;"><span style="font-family:Tahoma,sans-serif;"><span style="font-size:18.0pt;">fimH</span></span></span></span></em> <span style="color:black;"><span style="font-family:B Mitra;"><span style="font-size:18.0pt;">&nbsp;توسط روش واکنش زنجیره‌ای پلی‌مراز (</span></span></span><span dir="LTR"><span style="color:black;"><span style="font-family:Tahoma,sans-serif;"><span style="font-size:18.0pt;">PCR</span></span></span></span><span style="color:black;"><span style="font-family:B Mitra;"><span style="font-size:18.0pt;">) بررسی شد. نتایج مطالعه با استفاده از نرم‌افزار </span></span></span><span dir="LTR"><span style="color:black;"><span style="font-family:Tahoma,sans-serif;"><span style="font-size:18.0pt;">SPSS</span></span></span></span><span style="color:black;"><span style="font-family:B Mitra;"><span style="font-size:18.0pt;"> نسخه 22 تجزیه و تحلیل شد. تجزیه و تحلیل آماری با استفاده از آزمون‌های </span></span></span><span dir="LTR"><span style="color:black;"><span style="font-family:Tahoma,sans-serif;"><span style="font-size:18.0pt;">Man-Whitney </span></span></span></span><span style="color:black;"><span style="font-family:B Mitra;"><span style="font-size:18.0pt;">، </span></span></span><span dir="LTR"><span style="color:black;"><span style="font-family:Tahoma,sans-serif;"><span style="font-size:18.0pt;">Chi-square</span></span></span></span><span style="color:black;"><span style="font-family:B Mitra;"><span style="font-size:18.0pt;"> و با&nbsp; سطح معناداری 05/0</span></span></span><span dir="LTR"><span style="color:black;"><span style="font-family:Tahoma,sans-serif;"><span style="font-size:18.0pt;"><</span></span></span></span> <em><span dir="LTR"><span style="color:black;"><span style="font-family:Tahoma,sans-serif;"><span style="font-size:18.0pt;">P</span></span></span></span></em><span style="color:black;"><span style="font-family:B Mitra;"><span style="font-size:18.0pt;">&nbsp; انجام شد.</span></span></span><br> <strong><span style="font-family:B Mitra;"><span style="font-size:18.0pt;">نتایج:</span></span></strong><span style="font-family:B Mitra;"><span style="font-size:18.0pt;"> از 235 نمونه ادراری، تعداد 75 نمونه (9/31 درصد) حاوی باکتری <em>اشریشیاکلی</em> بودند. با استفاده از تست آنتی بیوگرام، تعداد 47 نمونه (7/62 درصد) از جدایه‌های <em>اشریشیاکلی</em> مقاوم به ایمی‌پنم</span></span> <span style="font-family:B Mitra;"><span style="font-size:18.0pt;">تشخیص داده شدند. پس از انجام واکنش </span></span><span dir="LTR"><span style="font-family:Tahoma,sans-serif;"><span style="font-size:18.0pt;">PCR</span></span></span><span style="font-family:B Mitra;"><span style="font-size:18.0pt;">، مشخص شد که تعداد 28 جدایه (6/59 درصد) از نظر حضور ژن </span></span><em><span dir="LTR"><span style="font-family:Tahoma,sans-serif;"><span style="font-size:18.0pt;">fimH</span></span></span></em><span style="font-family:B Mitra;"><span style="font-size:18.0pt;">، هشت جدایه (17 درصد) از نظر حضور ژن </span></span><em><span dir="LTR"><span style="font-family:Tahoma,sans-serif;"><span style="font-size:18.0pt;">papEF</span></span></span></em><span style="font-family:B Mitra;"><span style="font-size:18.0pt;"> &nbsp;و 19 جدایه (42/40 درصد) از نظر حضور ژن </span></span><em><span dir="LTR"><span style="font-family:Tahoma,sans-serif;"><span style="font-size:18.0pt;">sfaD</span></span></span></em><span style="font-family:B Mitra;"><span style="font-size:18.0pt;"> مثبت بودند. نتایج نشان داد که در بین سویه‌های مطالعه شده، ژن </span></span><em><span dir="LTR"><span style="font-family:Tahoma,sans-serif;"><span style="font-size:18.0pt;">fimH</span></span></span></em><span style="font-family:B Mitra;"><span style="font-size:18.0pt;"> شایع‌ترین ژن کد‌کننده فیمبریه در <em>اشریشیاکلی</em>‌های جداشده از عفونت ادراری در شهر آمل بود. <span style="color:black;">هرچند این یافته به لحاظ آماری معنادار نبود (05/0</span></span></span><span dir="LTR"><span style="color:black;"><span style="font-family:Tahoma,sans-serif;"><span style="font-size:18.0pt;">></span></span></span></span> <em><span dir="LTR"><span style="color:black;"><span style="font-family:Tahoma,sans-serif;"><span style="font-size:18.0pt;">P</span></span></span></span></em><span style="color:black;"><span style="font-family:B Mitra;"><span style="font-size:18.0pt;">). همچنین در بررسی آماری نتایج مقاومت آنتی‌بیوتیکی و حضور ژن‌های حدت فیمبریال، هیچ ارتباط معناداری بین متغیرها (آنتی‌بیوتیک‌های مطالعه شده و ژن‌های حدت) مشاهده نشد (05/0</span></span></span><span dir="LTR"><span style="color:black;"><span style="font-family:Tahoma,sans-serif;"><span style="font-size:18.0pt;">></span></span></span></span> <em><span dir="LTR"><span style="color:black;"><span style="font-family:Tahoma,sans-serif;"><span style="font-size:18.0pt;">P</span></span></span></span></em><span style="color:black;"><span style="font-family:B Mitra;"><span style="font-size:18.0pt;">).</span></span></span><span style="font-family:B Mitra;"><span style="font-size:18.0pt;"></span></span><br> <strong><span style="font-family:B Mitra;"><span style="font-size:18.0pt;">نتیجه‌گیری: </span></span></strong><span style="font-family:B Mitra;"><span style="font-size:18.0pt;">به نظر می‌رسد ژن </span></span><em><span dir="LTR"><span style="font-family:Tahoma,sans-serif;"><span style="font-size:18.0pt;">fimH</span></span></span></em><span style="font-family:B Mitra;"><span style="font-size:18.0pt;"> شایع‌ترین ژن کد‌کننده فیمبریه در <em>اشریشیاکلی</em>‌های جداشده از عفونت ادراری در شهر آمل و عامل مهمی در بیماری‌زایی این باکتری است. بیشترین موارد ابتلا به عفونت ادراری، مرتبط با باکتری <em>اشریشیاکلی</em> حاوی ژن‌های نامبرده است، به همین دلیل تشخیص سریع آن‌ها در مبتلایان به عفونت ادراری می‌تواند به درمان سریع‌تر و بهتر مبتلایان کمک کند.</span></span></div> <div style="text-align: justify;"><strong>Background: </strong>Urinary tract infection is one of the most common bacterial infections in the world and Europathogenic <em>Escherichia</em> <em>coli</em> is one of the main causes of this infection. The presence of fimbrial genes causes the bacteria to attach to the cells of the urinary tract. The aim of the present study was to evaluate the presence of 3 fimbrial genes <em>papEF</em>, <em>sfaD</em>, and <em>fimH</em> in <em>Escherichia</em> <em>coli</em> isolated from patients with urinary tract infections.<br> <strong>Materials and methods:</strong> In the current cross-sectional study, 235 urine samples were randomly collected from patients referred to different laboratories in Amol between 2018-2019. First, each sample was cultured separately on EMB agar and then analyzed using biochemical tests, such as IMViC, TSI, and urease. In positive samples for the presence of <em>Escherichia</em> <em>coli</em>, antibiogram test was performed to evaluate the sensitivity to the imipenem. After DNA extraction from imipenem resistant samples via boiling method, the presence of <em>papEF</em>, <em>sfaD</em>, and <em>fimH</em> genes was examined using Polymerase Chain Reaction (PCR). The results of the study were analyzed in SPSS, version 22. Statistical analyses were performed running Man-Whitney and Chi-square tests with a significance level of <em>P<</em>0.05.<strong><span dir="RTL"></span></strong><br> <strong>Results:</strong> From among the 235 urine samples, 75 (31/9%) contained <em>Escherichia</em> <em>coli</em> bacteria. Also, 47 samples (62/7%) were detected from imipenem-resistant Escherichia coli isolates. After PCR reaction, it was found that 28 isolates (59/6%) were positive for <em>fimH</em> gene, 8 isolates (17%) were positive for <em>pap</em><em>EF</em> gene, and 19 isolates (40/42%) were positive for <em>sfaD</em> gene. The results showed that, among the studied strains, <em>fimH</em> gene was the most common gene encoding fimbriae in <em>Escherichia coli</em> isolated from urinary tract infection in Amol city. However, this finding was not statistically significant (<em>P <</em>0.05). Also, in the statistical study of the results of antibiotic resistance and the presence of fimbrial virulence genes, no significant relationship was observed between the variables (<em>P <</em>0.05).<strong><span dir="RTL"></span></strong><br> <strong>Conclusion:</strong> It seems that <em>fimH</em> gene is the most common gene encoding fimbrial in <em>Escherichia</em> <em>coli</em> isolated from urinary tract infections in Amol city and is an important factor in the pathogenicity of this bacteria. Most cases of urinary tract infections are associated with Escherichia coli bacteria that contain these genes, so its early detection in patients with urinary tract infections can help treat patients in a faster and better way.</div> عفونت دستگاه ادراری, ژن‌های فیمبریه, اشریشیاکلی, ایمی‌پنم Urinary tract infections, fimbrial genes, Escherichia coli, Imipenem 96 101 http://pejouhesh.sbmu.ac.ir/browse.php?a_code=A-10-4161-1&slc_lang=fa&sid=1 Rahem khoshbakht راحم خوشبخت 100319475328460028257 100319475328460028257 No Assistant Professor, Department of Pathobiology, Faculty of Veterinary Medicine, Amol University of Special Modern Technologies, Amol, Iran استادیار، گروه پاتوبیولوژی، دانشکده دامپزشکی، دانشگاه تخصصی فناوری های نوین آمل، آمل، ایران zahra panahi زهرا پناهی za.panahi@mail.um.ac.ir 100319475328460028258 100319475328460028258 Yes PhD student, Department of Food hygiene and Aquaculture, Faculty of Veterinary Medicine, Ferdowsi University of Mashhad, Mashhad, Iran دانشجوی دکترا، گروه بهداشت مواد غذایی و آبزیان، دانشکده دامپزشکی، دانشگاه فردوسی مشهد، مشهد، ایران Faezeh Alizadeh فائزه علیزاده 100319475328460028259 100319475328460028259 No Bachelor of Veterinary Laboratory Science, Department of Pathobiology, Faculty of Veterinary Medicine, Amol University of Special Modern Technologies, Amol, Iran لیسانس علوم آزمایشگاهی دامپزشکی، گروه پاتوبیولوژی، دانشکده دامپزشکی، دانشگاه تخصصی فناوری های نوین آمل، آمل، ایران